根据去除水方式的不同，反渗透系统的原水水源可分为地下水及地表水两类。在国内纯净水处理工艺中比较常用的是自来水。水源实际上也是由地下水或地表水制取而得，海水取水方式也常用敞开取水（表层水）或海边打井的方式。

　　采用地表水作为进水水源时，应了解水源水系的情况，洪水期与枯水期水质变化的情况，上游厂矿对水源污染或可能污染的情况等。由于地表水水质不仅随季节而有周期性的变化，而且也有干旱和多雨年的不同，对于一定的水源来说，水中的年平均含盐量并不是不变的，在干旱年间其年平均含盐量较多，在多雨年间其年平均含盐量就比较低，所以对地表水除了要掌握历年水质变化规律的资料，这样才可以使设计的反渗透系统，在进水水质最坏的情况下也可以满足用户的要求。

　　采用地下水时，应了解地下水源补给情况和地层地质概况。地下水一般比较稳定。但也应收集一年四季的水质全分析资料作为设计依据。对于某些浅水井，如其邻近还有厂矿等企业，其水质有被污染可能时还应进行调查和研究收集更多有代表性的资料。

　　对水源各种代表性水质的分析结果，应进行审核，发现误差太大时还应重新收集资料，进行分析。由于反渗透系统的特殊性，因而在进行水质分析时，除了要包括常规的分析项目外，还需要包括一些比较特殊的项目如浊度SDI值等，这些项目是在设计反渗透系统时不可缺少的数据。

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