首先了解下HPLC用超纯水的来源：
    1 专门的纯水机或超纯水机；
    2 去离子水重蒸；
    3 二次或三次重蒸水；
    4 采用类似家用的纯水机；
    5 市场上瓶装的纯净水或蒸馏水；
    6 其它途径
    不管采用何途径，配制流动相应用新鲜水，水质越高放置时间越短
    理想的HPLC用水应18.2Ω的超纯水，并通过0.22um的滤膜，除去热源、有机物、无机离子及空气等
    随着时代和科技的发展，高效液相等精密分析仪器已普及至与分析测试有关的行业，对实验水质要求也愈来愈高现今高效液相(HPLC) 都要求用户使用超纯水定出平坦而没有波峰的基线以保证分析测试的灵敏度，但有部分HPLC用户因资金或习惯等原因仍沿用瓶装饮用纯净水或蒸馏水进行实验,效果往往不很理想。
    瓶装纯净水和蒸馏水均只是普通纯水而不是高纯水，水中仍含有少量离子和有机物等杂质，用以配制液相和洗脱液不仅可能污堵昂贵的色谱柱，也影响HPLC定出平坦的基线。
    瓶装纯净水的纯化工艺，通常包括吸附、过滤、反渗透等，对颗粒性有机物的去除效果较好，但对微量有机物的去除却不能满足高灵敏度的HPLC实验之需求，并且，由于其包装通常PVC瓶，透氧率高，同时存在定的化学溶出量，从而污染瓶中的纯净水，尤其是保存一段时间后，水质下降多，因此表现在HPLC色谱图上，虽无特定吸收峰，但基线存在较严重的不稳干扰。
    有专家对重蒸水进行HPLC检测时发现，254nm和214nm在22-27分钟时都出现较强的吸收峰，表明有疏水性较强的有机物污染，其原因应是蒸馏过程的共沸现象导致了某些挥发性有机物去除不彻底。