传统海水原水处理工艺：
       简单沉淀-过滤-气浮-消毒，其中过滤采用三级砂滤；气浮采用射流气浮工艺，主要目的是除去海水中氨氮和蛋白质，对海水中重金属没有处理效果，该工艺也只有少量苗场使用；消毒主要采用氯制剂、碘制剂等化学消毒方式，有一定药物残留，对幼苗影响大。
 
AFF-引气气浮- MBFB-紫外消毒养殖育苗原水解毒工艺：
       AFF-引气气浮-MBFB-ACFF-紫外消毒工艺，其中AFF直接滤除原水中直径大于5μm悬浮物；气浮采用引气气浮工艺，通过添加重金属捕捉剂，除去海水中重金属； PACBFB-MBR和ACFF都是环境激素处理技术，能有效除去水体中难降解小分子有毒有机化合物；
      消毒主要采用紫外消毒或光催化消毒工艺，消毒效率高，无药物残留。
      淡水原水处理工艺和海水大同小异，只是没有气浮工段，其重金属除去手段主要是在AFF过滤时，加入重金属捕捉剂，同时也作为生物絮凝剂，将水体中分子量大于10000D的有机物絮凝，便于AFF滤除。

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