水处理系统顾名思义，就是处理水的设备系统。

一套完整的水系统分别由预处理系统、反渗透主机系统、后处理系统和清洗系统共同组成。         

以纯水设备为例，纯水设备系统也包括预处理、主机、后处理。

一、预处理，常常由砂滤装置，碳滤装置，精密过滤装置组成，主要目的是去除原水中含有的泥沙、铁锈、胶体物质、悬浮物，色素、异味、生化有机物，降低水的余氨值及农药污染等有害的物质。如果原水中钙镁离子含量较高时，还需增加软水装置，主要目的在于保护主机部分的反渗透膜不受大颗粒物质的破坏，从而延长反透膜的使用寿命。

二、纯水设备主机系统，主要由增压泵，膜壳，反渗透膜，控制电路等组成，是整个水处理系统中的核心部分，产水水质的好坏最主要也取决该部分。只要膜的型号及增压泵的型号选取得当，主机部分对水中盐分的过滤能力都能达到99%以上，出水电导率可保证在10us/cm（25度）以内。

三、后处理系统，主要是对主机制取的纯水作进一步的处理，如果后续工艺接离子交换或电去离子设备（EDI），则可以制取工业用超纯水，如果是用在民用直饮水工艺上，则常常接后置杀菌装置，例如可以接紫外线杀菌灯或者臭氧发生器，从而使出来的水可以直接饮用。                         

四、清洗系统，为了保证水系统的正常运行及延长主机反渗透膜元件的使用寿命，当主机系统运行一段时间后为去除碳酸钙垢、水中金属氧化物垢、生物滋长（细菌、真菌、霉菌等）等物质就需要对系统进行清洗。