抗菌素工业废水主要包括发酵废水、酸碱废水、有机溶剂及洗涤废水等，其中发酵废水的有机物浓度较高，COD达几万mg/l，而且废水中的残余抗生素对微生物具有抑制作用，使生物处理效率低。此外，该类废水悬浮物含量高、色度高。

    合成药物生产废水：有机物浓度中等，COD在1000mg/l左右，可生化性一般，有的较差，常含有氨氮、油类和一些金属离子，如铬、铜和铅等。这些有毒物质不仅污染环境，而且增加了生物处理的难度。

    中成药生产废水：废水主要来自原料的洗涤水、原药煎汁和冲洗水，COD数千mg/l，可生化性尚佳。

    总之，制药废水水质水量波动较大，是处理难度较大的工业废水之一。所采用处理方法应根据具体情况进行选择。

    厌氧法可处理有机物浓度较高的废水，节省能源并能副产甲烷等可回收能源，剩余污泥量较少，因此，在制药废水处理中应用较多。好氧生物处理是制药废水处理中应用最广泛的方法，如活性污泥法、深井曝气法、SBR、接触氧化法等应用较为普遍。但由于制药废水处理难度较大，排放标准日趋严格，单一靠一种方法很难达到排放要求，因此，在工程中常用组合处理工艺，如厌氧——好氧生物处理工艺、水解酸化——好氧生物处理工艺、深井曝气——SBR处理工艺、生物处理——物化处理工艺等。对一些浓度高、对生物具有抑制作用的废水，采用湿室空气氧化法（WAO）是行之有效的。其原理是将溶于水或者悬浮于水中的有机物，在高温高压下用空气进行氧化，大幅度降低化学耗氧量。湿式空气氧化法温度为150～300℃，压力为1.5～15MPa，并加入合适的催化剂，用此法处理难以用生化法处理的硝基废水可以获得良好的效果，但投资和运行费用很高。治理总是被动的，应从改革生产工艺着手推荐清洁生产，从源头减少污染物排放才是最根本和最有效的途径。